Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms1Q8VCQ6 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sgms1Q8VCQ6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.1 ms