Protein–RNA interactions for Protein: Q8R332

Nup58, Nucleoporin p58/p45, mousemouse

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Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup58Q8R332 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nup58Q8R332 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Nup58Q8R332 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Nup58Q8R332 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nup58Q8R332 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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