Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Hoxc12Q8K5B8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxc12Q8K5B8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxc12Q8K5B8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxc12Q8K5B8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxc12Q8K5B8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxc12Q8K5B8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxc12Q8K5B8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Hoxc12Q8K5B8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxc12Q8K5B8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hoxc12Q8K5B8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Hoxc12Q8K5B8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
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