Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp45Q8K387 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms