Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Gtf3c1Q8K284 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gtf3c1Q8K284 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms