Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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