Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc38Q8CDN8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc38Q8CDN8 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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