Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SynpoQ8CC35 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms