Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9M2

Ccdc15, Coiled-coil domain-containing protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc15Q8C9M2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc15Q8C9M2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms