Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
BC049762Q8C601 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
BC049762Q8C601 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms