Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Atg16l1Q8C0J2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms