Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Olfr1163-202ENSMUST00000215268 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm14481-201ENSMUST00000117178 629 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm5861-201ENSMUST00000168407 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Gm6460-201ENSMUST00000088616 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trim35Q8C006 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm37490-201ENSMUST00000195566 724 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm5684-201ENSMUST00000198419 961 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Gm15283-202ENSMUST00000221427 818 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Cd48-202ENSMUST00000068584 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trim35Q8C006 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms