Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Pggt1bQ8BUY9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Pggt1bQ8BUY9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Pggt1bQ8BUY9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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