Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gpc2Q8BKV1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gpc2Q8BKV1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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