Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrtm2Q8BGA3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms