Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ChfrQ810L3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms