Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Ttc28Q80XJ3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms