Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cfap100Q80VN0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms