Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ttc29Q80VM3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Ttc29Q80VM3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ttc29Q80VM3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ttc29Q80VM3 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ttc29Q80VM3 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ttc29Q80VM3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ttc29Q80VM3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Ttc29Q80VM3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ttc29Q80VM3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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Ttc29Q80VM3 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ttc29Q80VM3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Ttc29Q80VM3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ttc29Q80VM3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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