Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Lamp3Q7TST5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms