Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zfp397Q7TNK4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp397Q7TNK4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms