Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Scn4bQ7M729 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Scn4bQ7M729 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Scn4bQ7M729 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Scn4bQ7M729 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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