Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms