Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sohlh1Q6IUP1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sohlh1Q6IUP1 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms