Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krt87Q6IMF0 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms