Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scaf8Q6DID3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms