Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sv2cQ69ZS6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms