Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
PtprdQ64487 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms