Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gja3Q64448 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gja3Q64448 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms