Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PatjQ63ZW7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms