Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Rbm38Q62176 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Rbm38Q62176 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Rbm38Q62176 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Rbm38Q62176 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Rbm38Q62176 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Rbm38Q62176 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rbm38Q62176 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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