Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Prkd1Q62101 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms