Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Itga6Q61739 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Itga6Q61739 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms