Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ifi47Q61635 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms