Protein–RNA interactions for Protein: Q61508

Ecm1, Extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm1Q61508 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ecm1Q61508 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms