Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cln3Q61124 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cln3Q61124 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cln3Q61124 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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