Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lamb3Q61087 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms