Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
JrkQ60976 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms