Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Traf3Q60803 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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