Protein–RNA interactions for Protein: Q5F204

Mdh1b, Putative malate dehydrogenase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdh1bQ5F204 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mdh1bQ5F204 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mdh1bQ5F204 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms