Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA2

Cdv3, Protein CDV3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdv3Q4VAA2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm20854-201ENSMUST00000178889 1002 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cdv3Q4VAA2 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms