Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trappc3lQ4KL14 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms