Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm5935Q497S0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms