Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ckap2Q3V1H1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2Q3V1H1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms