Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Obox3Q3UT54 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms