Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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D13Ertd608eQ3UPR8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
D13Ertd608eQ3UPR8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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D13Ertd608eQ3UPR8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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