Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrc4Q3UP24 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrc4Q3UP24 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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