Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms