Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nom1Q3UFM5 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms