Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ssbp4Q3U4B1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssbp4Q3U4B1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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